Я бы хотел видеть архитектуры машинного обучения, оптимизированные для биологических задач, а не просто заимствованные, оптимизированные для NLP/Vision.

Этот стэнфордский проект cs224n может представлять интерес для автора http://web.stanford.edu/class/cs224n/reports/6838544.pdf